DNA降解的因素：
 

　　外界物理因素:温度、湿度
 

　　化学因素：pH值、水解反应、氧化反应
 

　　生物因素：酶解及微生物侵染等作用。
 

　　这些因素都直接与DNA的构型、分子组成有关
 

　　DNA分子结构：
 

　　DNA是由许多脱氧核苷酸残基按一定顺序彼此用3’，5’-磷酸二酯键相连构成的长链。
 

　　[形成链的作用力——磷酸二脂键，易被水解]；
 

　　大多数DNA含有两条这样的长链
 

　　[两条链间以氢键相连接——氢键在强电解质环境，尤其在高酸度环境内易开键]
 

　　也有的DNA为单链，如大肠杆菌噬菌体φX174、G4、M13等。有的DNA为环形，有的DNA为线形。
 

　　选取的材料不新鲜或反复冻融，采集材料后未及时处理或未低温保存：陈旧血液或不新鲜的材料中，细胞凋亡导致DNA降解，或者低温保存的样品经反复冻融导致细胞破碎，内源性核酸酶降解DNA，因此应该选用新鲜的材料样品，不能及时处理则低温保存，运输过程中应该使用干冰：
 

　　1 ) 未能有效的抑制内源性核酸酶的作用：
 

　　某些DNase含量丰富的动植物组织样品应在液氮中研磨或匀浆，研磨过称中随时补充液氮，并在样品未*解冻之前加入含有抑制核酸酶作用的裂解液。
 

　　2 ) 操作过于剧烈导致 DNA 被机械打断：
 

　　预处理的样品应该加入细胞裂解以后，所有操作应该尽量柔和，避免剧烈振荡。